Erobringen av Oaxaca var relativt fredelig, siden Zapotec og Mixtec-herrene trodde de i europeerne ville finne de allierte de trengte for å beseire aztekerne.
På den annen side motsto andre grupper som Zapotecs of the Sierra, Chontales og spesielt Mixes og gjennomførte en etterfølger av opprør. Ved sin triumf, og fremdeles på 1500-tallet, strippet spanjolene de innfødte av landene sine, legaliserte denne handlingen gjennom innkomster, mercedes og splittelser gitt av kongen, og skisserte dermed fra begynnelsen av den spanske erobringen, ubalansen og ulikhet som ville herske mellom det spanske og det urfolkssamfunnet.
Overgrepene fra kolonisatorene var så store at en god del av arbeidet som ble utført av de to Audiencias og visekongen Antonio de Mendoza var rettet mot å begrense makten til markisen til Valle de Oaxaca, Hernán Cortés, og den til encomenderos. De foreslo således å styrke den kongelige autoriteten, og det ble derfor de nye lovene (1542) ble kunngjort og en kompleks administrasjon ble opprettet. Oppgaven med evangelisering i Mixtec- og Zapotec-området var den dominikanske ordenens arbeid som bygde, med i utgangspunktet urfolksarbeid, overdådige kirker og klostre på stedene der de store befolkningssentrene var konsentrert, som byen Antequera, Yanhuitián og Cuilapan. .
Den åndelige erobringen var mer radikal og voldelig enn den militære erobringen. For å opprettholde kontrollen over befolkningen opprettholdt erobrerne, med modifikasjoner, visse urbefolkningsstrukturer på en slik måte at noen av høvdingene i Oaxaca-dalen og Mixteca Alta klarte å bevare eldgamle privilegier og eiendommer; I stedet for å konvertere folkeslagene i Amerika til kristendommen, forsøkte misjonærene å ødelegge spor etter religionen fra den pre-spanske verden.
Til tross for den demografiske nedgangen i den innfødte befolkningen, forårsaket av epidemier og mishandling, var 1500-tallet en av økonomisk vekst på grunn av introduksjonen av nye teknikker, avlinger og arter. I Mixteca ble det for eksempel oppnådd god fortjeneste ved utnyttelse av silkeorm, storfe og hvete. Utviklingen av bymarkedet og gruvene bidro til denne veksten.
Denne velstanden ble imidlertid avbrutt av problemene som gruvedrift sto overfor siden 1590. Handelen mellom Sevilla og Amerika gikk ned og nedgangen i befolkningen førte til at forbruket i byene gikk ned, og arbeidsstyrken ble redusert til et minimumsuttrykk.
I det syttende århundre var den økonomiske depresjonen da de definerte kolonistrukturene, dominansordningen ble konsolidert og mekanismene til en avhengig økonomi ble etablert. Anvendelsen av et monopol og en sentralisert kommersiell ordning hemmet regional økonomisk utvikling og forårsaket områder som var så rike som Oaxaca-dalen for å lede økonomien mot selvforsyning til tross for viktigheten av produksjon og handel med kakao, indigo og cochineal. .
Allerede i andre halvdel av det syttende århundre begynte økonomien i det nye Spania å forbedre seg: gruveproduksjonen hadde en rebound, handel med Mellom-Amerika og Peru ble tillatt igjen, og urbefolkningen begynte å komme seg. På denne tiden viet spanjolene som bodde i Mixteca og i Oaxaca-dalen, til storfejordbruk i store proporsjoner, og gårdene kombinerte vellykket produksjon av hvete og mais med oppdrett av storfe. Koloniens økonomi ble omstrukturert mellom 1660 og 1692, og la grunnlaget for opplysningstallet.
Nye Spania vokser og blomstrer i opplysningstiden. Territoriet dobles, befolkningen tredobles og verdien av økonomisk produksjon er seks ganger. Det beste eksemplet på disse fremskrittene er observert innen gruvedrift, en sentral økonomisk akse som, mens den fremdeles var slaver, gikk fra å jobbe 3.300.000 pesos i 1670 til 27.000.000 i 1804.
Overfloden i det nye Spania manifesteres i den intense byggeaktiviteten og renner over i barokkens prakt, det var da de i Antequera blant annet bygde kapellet i rosenkransen til kirken Santo Domingo, kirken Soledad, San Agustín og Consolación.
Det 18. århundre var århundret med modernisering av politiske og økonomiske reformer gjennomført av Bourbon-kongene.
I 1800 hadde Mexico blitt et land med ekstraordinær rikdom, men også ekstrem fattigdom, flertallet av befolkningen var knyttet til haciendene og kommunene, de ble mishandlet på arbeidsplassen, slaver i gruvene og møllene, uten frihet, uten penger. og uten mulighet til å forbedre seg.
Halvøysspanjolene monopoliserte politisk og økonomisk makt; Slike forhold med sosial, økonomisk og politisk ulikhet akkumulerte spenninger og misnøye. På den annen side rokker virkningen av hendelser som den franske revolusjonen, USAs uavhengighet og den engelske industrielle revolusjonen amerikansk samvittighet, og ideen om uavhengigheten av det nye Spania begynner å ta form i kreolene.
